主角陈鱼是一个能看见别人“记忆破洞”的女孩，她偶然走进一家名为“洞洞”的杂货铺，店主阿望递给她一枚“补洞针”，只要缝补别人的记忆破洞，就能换取自己遗忘的片段。陈鱼在帮助邻居修补遗憾的同时，逐渐回忆起自己五岁时被拐卖的真相，而店主阿望竟是当年救过她的那个小男孩。
陈鱼用补洞针缝上最后一块碎片，童年记忆完整浮现——阿望就是当年牵着她逃跑的男孩，两人相拥而泣。
陈鱼发现阿望的记忆破洞最大，补洞针无法修补，原来他为了救她，将自己的记忆碎片喂给了“洞”。
楼上的老画家临终前委托陈鱼修补他与亡妻的“初次相遇”记忆，完成后老画家安然离世。
陈鱼听到小巷里有女人在哭，帮她修补“孩子失踪那天的记忆”，发现线索指向自己家附近。
陈鱼在杂货铺第一次拿起补洞针，轻轻刺入阿望展示的布偶，布偶身上的洞消失，她感到一阵暖意。
陈鱼因为总能梦见陌生片段而苦恼，路过杂货铺时被橱窗里的针线盒吸引，阿望说“你终于来了”。